Ошибка сборщика генома Platanus_allee - PullRequest
0 голосов
/ 09 ноября 2019

Я пытаюсь запустить сборщик генома Platanus_allee для сборки генома. Однако, когда я запускаю команду фазы, она выдает следующую ошибку:

Моя команда:

bio @ bio-XPS-8700: ~ / Fareeha /Platanus / Platanus_allee_v2.0.2_Linux_x86_64 $ ./platanus_allee phase -c out_contig.fa out_junctionKmer.fa \ platanus_allee phase \ -c out_contig.fa out_junctionKmer.fa \ -IP1 / home / bio / Fareeha / test / SDhead-test_d_d_2_d_1_d_d_1_d_2_1_d_d_2_d_1_d_1-3000000.fq /home/bio/Fareeha/test/SMIX_test_data/Unzip/SDNA-270_2_head-3000000.fq \ 2> phase.log

Вывод:

platanus_allee версия: 2.0.2

. / Platanus_allee фаза -c out_contig.fa out_junctionKmer.fa platanus_allee фаза -c out_contig.fa out_junctionKmer.fa -IP1 / home / bio / Fareeha / test / SMIX_test_data /Unzip / SDNA-270_1_head-3000000.fq /home/bio/Fareeha/test/SMIX_test_data/Unzip/SDNA-270_2_head-3000000.fq 2

Error(13): Error, SolveDBG exception!! 
platanus_allee solve_DBG command failed.

Может кто-нибудь помочь мнереши это ?

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...