Почему мой CNN всегда выводит позитив, даже на изображениях тренировочных наборов? - PullRequest
0 голосов
/ 10 января 2020

Я делаю сайт по скринингу глаукомы, используя модель машинного обучения / глубокого обучения. Я использую керас. Однако моя программа всегда выдает глаукому Да, даже на изображениях в тренировочном наборе, поэтому мы не уверены, как модель может испортить входные данные, непосредственно поступающие из обучающего набора.

Вот мой код для модели:

from keras.preprocessing.image import ImageDataGenerator
from keras.models import Model
from keras.layers import Input, Conv2D, MaxPooling2D, GlobalAveragePooling2D
from keras.layers import BatchNormalization, Activation, Dropout, Flatten, Dense
from keras import backend as K
from keras import optimizers
from keras.callbacks import ModelCheckpoint, ReduceLROnPlateau
from imgaug import augmenters as iaa
import os

img_width, img_height = 256, 256
input_shape = (img_width, img_height, 3)

train_data_dir = "data/train"
validation_data_dir = "data/validation"
nb_train_samples = sum([len(files) for r, d, files in os.walk(train_data_dir)])
nb_validation_samples = sum([len(files) for r, d, files in os.walk(validation_data_dir)])
batch_size = 16
epochs = 100

input = Input(shape=input_shape)

block1 = BatchNormalization(name='norm_0')(input)

# Block 1
block1 = Conv2D(8, (3,3), name='conv_11', activation='relu')(block1)
block1 = Conv2D(16, (3,3), name='conv_12', activation='relu')(block1)
block1 = Conv2D(32, (3,3), name='conv_13', activation='relu')(block1)
block1 = Conv2D(64, (3,3), name='conv_14', activation='relu')(block1)
block1 = MaxPooling2D(pool_size=(2, 2))(block1)
block1 = BatchNormalization(name='norm_1')(block1)

block1 = Conv2D(16, 1)(block1)

# Block 2
block2 = Conv2D(32, (3,3), name='conv_21', activation='relu')(block1)
block2 = Conv2D(64, (3,3), name='conv_22', activation='relu')(block2)
block2 = Conv2D(64, (3,3), name='conv_23', activation='relu')(block2)
block2 = Conv2D(128, (3,3), name='conv_24', activation='relu')(block2)
block2 = MaxPooling2D(pool_size=(2, 2))(block2)
block2 = BatchNormalization(name='norm_2')(block2)

block2 = Conv2D(64, 1)(block2)

# Block 3
block3 = Conv2D(64, (3,3), name='conv_31', activation='relu')(block2)
block3 = Conv2D(128, (3,3), name='conv_32', activation='relu')(block3)
block3 = Conv2D(128, (3,3), name='conv_33', activation='relu')(block3)
block3 = Conv2D(64, (3,3), name='conv_34', activation='relu')(block3)
block3 = MaxPooling2D(pool_size=(2, 2))(block3)
block3 = BatchNormalization(name='norm_3')(block3)

# Block 4
block4 = Conv2D(64, (3,3), name='conv_41', activation='relu')(block3)
block4 = Conv2D(32, (3,3), name='conv_42', activation='relu')(block4)
block4 = Conv2D(16, (3,3), name='conv_43', activation='relu')(block4)
block4 = Conv2D(8, (2,2), name='conv_44', activation='relu')(block4)
block4 = MaxPooling2D(pool_size=(2, 2))(block4)
block4 = BatchNormalization(name='norm_4')(block4)

block4 = Conv2D(2, 1)(block4)

block5 = GlobalAveragePooling2D()(block4)
output = Activation('softmax')(block5)

model = Model(inputs=[input], outputs=[output])
model.summary()
model.compile(loss="categorical_crossentropy", optimizer=optimizers.Adam(lr=0.0001, beta_1=0.9, beta_2=0.999, epsilon=None, decay=0.0, amsgrad=False), metrics=["accuracy"])

# Initiate the train and test generators with data Augumentation
sometimes = lambda aug: iaa.Sometimes(0.6, aug)
seq = iaa.Sequential([
                      iaa.GaussianBlur(sigma=(0 , 1.0)),
                      iaa.Sharpen(alpha=1, lightness=0),
                      iaa.CoarseDropout(p=0.1, size_percent=0.15),
                              sometimes(iaa.Affine(
                                                    scale={"x": (0.8, 1.2), "y": (0.8, 1.2)},
                                                    translate_percent={"x": (-0.2, 0.2), "y": (-0.2, 0.2)},
                                                    rotate=(-30, 30),
                                                    shear=(-16, 16)))
                    ])


train_datagen = ImageDataGenerator(
    rescale=1./255,
    preprocessing_function=seq.augment_image,
    horizontal_flip=True,
    vertical_flip=True)

test_datagen = ImageDataGenerator(
    rescale=1./255,
    horizontal_flip=True,
    vertical_flip=True)

train_generator = train_datagen.flow_from_directory(
    train_data_dir,
    target_size=(img_height, img_width),
    batch_size=batch_size,
    class_mode="categorical")

validation_generator = test_datagen.flow_from_directory(
    validation_data_dir,
    target_size=(img_height, img_width),
    class_mode="categorical")

# write HDF5 file
checkpoint = ModelCheckpoint("f1.h5", monitor='acc', verbose=1, save_best_only=True, save_weights_only=False, mode='auto', period=1)
reduce_lr = ReduceLROnPlateau(monitor='loss', factor=0.1, patience=2, verbose=0, mode='auto', cooldown=0, min_lr=0)

model.fit_generator(
    train_generator,
    steps_per_epoch=nb_train_samples,
    epochs=epochs,
    validation_data=validation_generator,
    validation_steps=nb_validation_samples,
    callbacks=[checkpoint, reduce_lr]
)

Почему это всегда выдает да глаукомы, даже на тренировочном наборе нет изображений глаукомы?

Спасибо, Сатья

1 Ответ

0 голосов
/ 10 января 2020

Как вы пришли к такому выводу? (Пожалуйста, улучшите свой вопрос, если этот ответ неверен)

Понятно, что вы используете функцию предварительной обработки в генераторе поездов и не используете ее в генераторе проверки. Первая возможная проблема: есть вероятность, что эти дополнения меняют вещи, которые они не должны менять, такие как масштаб, диапазон и т. Д. c. Если это правда, вы никогда не получите хороший результат проверки. (Если у вас хороший результат проверки, вы можете отказаться от этой возможности здесь)

Второй вариант: если вы знаете, что модель выдает положительный результат, вы дали ей изображения для прогнозирования. Вы обрабатывали эти изображения так же, как в генераторе поездов? (Та же шкала? Тот же размер? Существовала ли проблема 1 выше?)

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...