Если бы я понял, как правильно выглядит ваш фрейм данных (что-то, что будет создано через:)
df1 = data.frame(time = c(1.5, 3.5, 4.5, 5.5, 8.5, 9.5, 10.5, 11.5, 15.5, 16.5, 18.5, 23.5, 26.5), freq = c(1, 1, 2, 1, 2, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1, 1))
df2 = data.frame(time = c(0.5, 2.5, 3.5, 6.5, 15.5), freq = c(6, 2, 1, 1, 1))
Тогда вы получите то, что ищете:
df_new = data.frame(time = sort(unique(c(df1$time, df2$time))), var1 = sapply(sapply(time, function(x) {df1$freq[df1$time == x]}), function(x) {ifelse(length(x) == 0, 0, x)}), var2 = sapply((sapply(time, function(x) {df2$freq[df2$time == x]})), function(x) {ifelse(length(x) == 0, 0, x)}))
Надеюсь, это поможет,