У меня есть pandas фрейм данных с филогенией c информации о микробных сообществах в моем эксперименте.
Например, это первые несколько строк. Первый столбец - это последовательность 16-х годов. Остальные столбцы представляют собой phylogeneti c information.
Я хотел бы преобразовать это в phylogneti c дерево и раскрасить ветви дерева на основе моих экспериментальных условий (которые можно легко добавить в качестве другого столбца в кадре данных). Есть ли способ сделать это в био python? Это первый раз, когда я пытаюсь создать дерево филогенети c. Я никогда не использовал био python раньше. Я натолкнулся на эту ссылку , которая берет файлы fastta и преобразует их во что-то, что био python может использовать. Но кажется, что био python нуждается в . xml файле для создания деревьев. Буду признателен за любую помощь в этом.
Спасибо.