Как интерпретировать модель GAM из пакета GAM? - PullRequest
0 голосов
/ 06 апреля 2020

Я использую свою модель игры, чтобы предсказать риск развития висцерального лейшманиоза с использованием индекса растительности в качестве ковариации (Результат ~ ndvi). Тем не менее, я не знаю, как интерпретировать эти результаты. Моя модель не имеет значительного p-значения, согласно резюме. Может ли кто-нибудь объяснить мне, если это линейные отношения или нет (функция)? Является ли значение p релевантным для объяснения моих гипотез? Потому что сетка, которую я экспортировал, кажется очень последовательной (см. Рисунок ниже). Я использовал перекрестную проверку. Существуют ли какие-либо другие функции / материалы, которые могут помочь мне в интерпретации GAM? Я нашел некоторые материалы, но они о пакете mgcv. Мне нужно использовать gam для экспорта моей матрицы.

library(gam)

m.1=gam(Outcome~lo(Xcoord,Ycoord, ndvi, span=0.15), family=binomial(logit), data=pontos1)


> summary(m.1)

Call:
gam(formula = Outcome ~ lo(Xcoord, Ycoord, ndvi, span = 0.15), 
    family = binomial(logit), data = pontos1)

Deviance Residuals: 
    Min       1Q   Median       3Q      Max  
-0.6220  -0.4877  -0.4560  -0.4039   2.5978  

Coefficients:
                                              Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)   
(Intercept)                                 -3.660e+02  1.252e+02  -2.923  0.00347 **
lo(Xcoord, Ycoord, ndvi, span = 0.15)Xcoord -1.004e-05  2.067e-05  -0.486  0.62696   
lo(Xcoord, Ycoord, ndvi, span = 0.15)Ycoord  4.778e-05  1.619e-05   2.951  0.00317 **
lo(Xcoord, Ycoord, ndvi, span = 0.15)ndvi    6.169e-01  4.319e-01   1.428  0.15322   
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1

(Dispersion parameter for binomial family taken to be 1)

    Null deviance: 10356  on 15842.00  degrees of freedom
Residual deviance: 10226  on 15801.15  degrees of freedom
AIC: 10310

Number of Fisher Scoring iterations: 7

Spatial prediction of my GAM model

...