Вы можете использовать Network Workbench , который позволяет загружать данные в различных формах, включая списки ребер.Пограничные списки, как правило, являются самым простым форматом для генерации.
Я не совсем уверен, что вы можете экспортировать из NWB, чтобы сказать GraphML, но NWB включает в себя ряд визуализаций, некоторые из которых основаны на Prefuse.*
Если вы хотите сделать больше с вашими данными, чем , просто визуализируйте их, тогда NWB может вам помочь.