Как сказал Кристофер, вы можете удалить сборку, просто удалив каталог сборки на главном сервере внутри каталога задания.
Однако, если вы снова получите доступ к странице, данные сборки снова будут выгружены на диск. Таким образом, вы либо сначала выключаете Hudson, либо переходите на консоль управления Hudson и запускаете «Перезагрузить конфигурацию с диска», которая в основном отбрасывает все, что находится в памяти, и перезагружается из ваших файлов конфигурации.
Просто убедитесь, что вы делаете это сразу после удаления папки.