У меня была точно такая же проблема. Но в моем случае проблему не удалось решить, предоставив доступ на запись в программный каталог eclipse.
Причина была в том, что я пытался использовать две версии (Mars и Neon.2) затмения параллельно. Когда я попытался установить обе программы в один каталог в «C: \ Programm Files (x86) \ Eclipse», я не смог установить плагины и т. Д. До новой версии. Поэтому я удалил более новую версию и переустановил ее в «C: \ Programm Files (x86) \ Eclipse-Neon».
После этого все в порядке. Даже без разрешения на запись в каталог программ.