Одной из первых вещей, которые я устанавливаю при установке новой машины с Windows, является Cygwin. Я почти не считаю Windows готовой, пока она там не появится. С Cygwin я гарантирую, что rsync включен, и я бы использовал rsync, чтобы сделать копию, потому что это быстро и будет быстрее позже, когда мне просто нужно скопировать различия.
Теперь это большой молот, если это единственная причина, по которой вы устанавливаете Cygwin. Но если у вас уже есть, нет лучшего способа, чем rsync. Кроме того, документ rsync является одним из моих самых любимых. ;)