вывод xtable для списка таблиц - PullRequest
Новая
       20

вывод xtable для списка таблиц

2 голосов
/ 15 сентября 2011

У меня есть список таблиц, и я хочу добавить его для вывода LaTex. Вот код: 

Data <- esoph[ , 1:3]
library(plyr)
combos <- combn(ncol(Data),2)

TabelFn <- function(x) {
  Table <- addmargins(table(Data[, x[1]], Data[, x[2]]))
  return(Table)
  }

Table <- alply(.data=combos, .margins=2, .fun=TabelFn, .expand=TRUE)
library(xtable)

В этом списке Table есть три таблицы сопряженности, и я могу преобразовать вывод в LaTex, используя этот код: 

<< label = tabTable, echo = FALSE, results = tex >>=
print(xtable(Table[1]$'1', caption = "Contingency table for agegp and alcgp", label = "tab:Table[1]",
             digits = c(0, rep(0, ncol(Table[1]$'1'))),
             align = paste(paste("l|", paste(rep("r", ncol(Table[1]$'1')-1), collapse =     ''), sep = ""), "l", sep = "")),
      table.placement = "tbp", caption.placement = "top",
      hline.after = c(-1, 0, nrow(Table[1]$'1')))
@

Чтобы отправить вывод трех таблиц сопряженности, я должен написать три такие команды. В этом случае это возможно. Но для моих фактических данных у меня есть много таблиц непредвиденных обстоятельств. Я хотел бы знать, как более эффективно отправить все таблицы непредвиденных обстоятельств. Один из вариантов - просто напечатать список Table без xtable. Но я хотел бы иметь таблицу сопряженности в хорошем выходном формате. Спасибо за ваше время и помощь.

Ответы [ 2 ]

4 голосов
/ 15 сентября 2011

Мне нужны были некоторые фиктивные данные для работы с 

Data <- data.frame(a=rbinom(100,1,0.5), b=rbinom(100,1,0.3), c=rbinom(100,1,0.6))

С вашим кодом для генерации Table, это приблизит вас 

l_ply(Table, function(TBL) {
  print(xtable(TBL, 
      caption = "Contingency table for agegp and alcgp", #This information is not in the TBL anywhere
      label = "tab:Table[1]", # This is also problematic
      digits = c(0, rep(0, ncol(TBL))),
    align = paste(paste("l|", paste(rep("r", ncol(TBL)-1), collapse = ''), sep = ""), "l", sep = "")),
    table.placement = "tbp",
    caption.placement = "top",
    hline.after = c(-1, 0, nrow(TBL)))  
})

Вы можете получить метку правильно,итерации по индексу Table, а не по Table 

a_ply(seq_along(Table), 1, function(i) {
  print(xtable(Table[[i]], 
      caption = "Contingency table for agegp and alcgp", #This information is not in the Table[[i]] anywhere
      label = paste("tab:Table[",i,"]",sep=""), 
      digits = c(0, rep(0, ncol(Table[[i]]))),
    align = paste(paste("l|", paste(rep("r", ncol(Table[[i]])-1), collapse = ''), sep = ""), "l", sep = "")),
    table.placement = "tbp",
    caption.placement = "top",
    hline.after = c(-1, 0, nrow(Table[[i]])))       
})

Заголовок не может быть сделан автоматически, поскольку информации там нет.Однако, если вы измените свою функцию TableFn, вы можете добавить эту информацию и затем извлечь ее обратно. 

TabelFn <- function(x) {
  Table <- addmargins(table(Data[, x[1]], Data[, x[2]]))
  names(attr(Table,"dimnames")) <- names(Data)[x]
  return(Table)
}

Table <- alply(.data=combos, .margins=2, .fun=TabelFn, .expand=TRUE)

a_ply(seq_along(Table), 1, function(i) {
  vars <- names(attr(Table[[i]],"dimnames"))
  print(xtable(Table[[i]], 
      caption = paste("Contingency table for", vars[1], "and", vars[2]),
      label = paste("tab:Table[",i,"]",sep=""), # This is also problematic
      digits = c(0, rep(0, ncol(Table[[i]]))),
    align = paste(paste("l|", paste(rep("r", ncol(Table[[i]])-1), collapse = ''), sep = ""), "l", sep = "")),
    table.placement = "tbp",
    caption.placement = "top",
    hline.after = c(-1, 0, nrow(Table[[i]])))       
})
1 голос
/ 15 сентября 2011

Учитывая отсутствие фактических данных и их структуру, вот один из подходов. 

TabelFn2 <- function(x) {
  Table <- addmargins(table(Data[, x[1]], Data[, x[2]]))
  print(xtable(Table$'1', caption = "Contingency table for agegp and alcgp", 
       label = "tab:Table", digits = c(0, rep(0, ncol(Table$'1'))),
       align = paste(paste("l|", paste(rep("r", ncol(Table$'1')-1), 
       collapse = ''), sep = ""), "l", sep = "")),
      table.placement = "tbp", caption.placement = "top",
      hline.after = c(-1, 0, nrow(Table$'1')))
 }

<<echo = F, results = tex>>=
a_ply(.data=combos, .margins=2, .fun=TabelFn2)
@
...