появляется сообщение об ошибке, вызывающее rmblast - PullRequest
Новая
       24

появляется сообщение об ошибке, вызывающее rmblast

0 голосов
/ 05 июня 2019

Я использую Blast, но когда я вызываю его, появляется это сообщение: 

:~$ makeblastdb
USAGE
  makeblastdb [-h] [-help] [-in input_file] [-input_type type]
    -dbtype molecule_type [-title database_title] [-parse_seqids]
    [-hash_index] [-mask_data mask_data_files] [-mask_id mask_algo_ids]
    [-mask_desc mask_algo_descriptions] [-gi_mask]
    [-gi_mask_name gi_based_mask_names] [-out database_name]
    [-max_file_sz number_of_bytes] [-logfile File_Name] [-taxid TaxID]
    [-taxid_map TaxIDMapFile] [-version]

DESCRIPTION
   Application to create BLAST databases, version 2.5.0+

Use '-help' to print detailed descriptions of command line arguments
========================================================================

Error: Argument "dbtype". Mandatory value is missing:  `String, `nucl', `prot''
Error:  (CArgException::eNoArg) Argument "dbtype". Mandatory value is missing:  `String, `nucl', `prot''

Кто-нибудь может помочь мне интерпретировать это? Это в МИФЕ

...