Пакеты Bioconda r-wgcna и bioconductor-go.db не отображаются в R - PullRequest
2 голосов
/ 22 апреля 2019

Я использовал conda для установки R и WGCNA из канала bioconda, похоже, успешно:

$ conda list | grep bioconda
bioconductor-annotationdbi 1.44.0                   r351_0    bioconda
bioconductor-biobase      2.42.0           r351h1de35cc_1    bioconda
bioconductor-biocgenerics 0.28.0                   r351_1    bioconda
bioconductor-go.db        3.7.0                    r351_0    bioconda
bioconductor-impute       1.56.0           r351ha44fe06_0    bioconda
bioconductor-iranges      2.16.0           r351h1de35cc_0    bioconda
bioconductor-preprocesscore 1.44.0           r351h470a237_0    bioconda
bioconductor-s4vectors    0.20.1           r351h470a237_0    bioconda
r-wgcna                   1.66             r351h466af19_1    bioconda

Однако WGCNA и GO.db не отображаются в R с помощьюinstalled.packages(), хотя все остальные пакеты, перечисленные выше, делают.

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...