У меня есть тысячи файлов, которые представляют собой список имен последовательностей, за которыми...

У меня есть файл fasta, который содержит несколько сотен записей, но я пытаюсь вернуть таблицу...

У меня есть задание, в котором я должен написать класс Python для представления и манипулирования...

У меня есть файл fasta input.fa , который выглядит следующим образом: >KJH325_Org_name_strain...

В python этот код, где я непосредственно вызываю функцию SeqIO.parse (), работает нормально: from...

У меня есть файл «source.fasta», который содержит информацию в следующем формате:...

У меня есть такие данные >sp|Q96A73|P33MX_HUMAN Putative monooxygenase p33MONOX OS=Homo sapiens...

У меня есть следующий текст последовательности в файле каждый заголовок начинается с ">" количество...

У меня есть мультифаст-файл, и мне нужно удалить некоторую часть заголовка для каждого фаст-файла

У меня есть следующий код, который читает файл FASTA с 10 последовательностями генов и возвращает...

Я пишу сценарий, который может заменить все экземпляры аминокислотного остатка в столбце файла...

Я ищу решение R для извлечения нескольких последовательностей из файла FASTA на основе совпадения...

У меня есть файл fasta, из которого я должен генерировать kmers.Я пытаюсь поместить символы каждой...

Я использую функцию / подпрограмму extract_seq, доступную в Интернете, для извлечения...

У меня есть файл fasta, содержащий тысячи последовательностей. Появляется с этим форматом...

У меня есть несколько файлов fasta, загруженных из NCBI, и я хочу переименовать их с какой-то...

У меня есть несколько файлов fasta с одной последовательностью в одном каталоге. Я хочу...

я пробовал ls *.fasta | parallel --gnu "awk '{print $1}' > {/.}.outputfile

У меня есть два текстовых файла, и я хочу заменить id из file1 на file2.Все идентификаторы в одном...

У меня есть 2 файла: один представляет собой текстовый файл, который содержит серию идентификаторов...

У меня есть мультифаст-файл с именем fasta1.fasta, который содержит последовательности и их...

Мне нужно получить вывод, показанный ниже, из файла FASTA, но без использования BioPython.У...

Мне нужно получить тот же вывод, полученный с помощью следующего кода, но без использования...

Моя проблема больше в том, как переименовать строку заголовка для каждой последовательности fastta,...

У меня большой текстовый файл, подобный этому примеру: пример: >chr9:128683-128744...