Вопросы с тегом fasta - PullRequest

Вопросы с тегом fasta

1 голос
3 ответов

Я ищу способ идентифицировать FASTA -файлы как минимум с 3 последовательностями.Последовательности...

chippycentra / 24 мая 2019
1 голос
1 ответ

Я хочу объединить два файла fastta и удалить дублирующую информацию. Вот пример...

Helen / 23 мая 2019
0 голосов
0 ответов

Я хочу провести выравнивание гомологичных областей 30 множественных геномов с пакетом "DECIPHER" R....

Guillem / 13 мая 2019
0 голосов
0 ответов

У меня есть файл GFF. При открытии файла, строка за строкой, я хочу получить определенную...

SadieRose / 07 мая 2019
1 голос
1 ответ

Я пытаюсь написать скрипт, который использует agrep для циклического просмотра файлов в одном...

kjustin9 / 30 апреля 2019
3 голосов
1 ответ
0 голосов
1 ответ

Я хочу удалить все между ">" и "Un_" в заголовке, таком как >NW_017859640.1 Esox lucius isolate...

Ella Bowles / 24 апреля 2019
0 голосов
2 ответов

Во-первых, я ни в коем случае не эксперт по программированию и не очень хорошо разбираюсь в python,...

Kwojtus / 22 апреля 2019
0 голосов
1 ответ

У меня есть файл fasta (fasta - это файл, в котором строка заголовка начинается с >, за которым...

MAPK / 18 апреля 2019
2 голосов
7 ответов

У меня есть текстовый файл последовательностей символов, который состоит из двух строк: заголовка и...

Loïs Rancilhac / 11 апреля 2019
1 голос
0 ответов

Я пытаюсь извлечь информацию из мультифаст-файла (например, C / G / A / T count, CG%), используя...

egeorgia / 11 апреля 2019
0 голосов
0 ответов

У меня есть геном около 2 ГБ, состоящий из эшафот Я бы случайно выбрал геном. Я использовал...

jonny jeep / 10 апреля 2019
0 голосов
4 ответов

Я хочу изменить части моего заголовка fastta со списком с частями .tsv. Я не Биоинформатик, а...

CptChiler / 09 апреля 2019
2 голосов
1 ответ

Я пытаюсь создать фрейм данных из файлов фаста, которые содержат заголовок (имя контига) и...

MeggyClay / 06 апреля 2019
1 голос
1 ответ

У меня есть файл fasta (состоит из> строк заголовка и последовательности), как показано ниже:...

MAPK / 04 апреля 2019
1 голос
2 ответов

У меня есть файл в следующем формате: TRINITY_DN119001_c0_g1_i1 4 * 0 0 * * 0 0...

shome / 04 апреля 2019
0 голосов
2 ответов

Исходя из фона R, я хотел попробовать вложенный цикл for в python.У меня возникают проблемы с...

MAPK / 28 марта 2019
0 голосов
1 ответ

Я хотел бы извлечь все записи из файла фаста, которые относятся к таксономии человека, и сделать...

Joe Otto / 28 марта 2019
4 голосов
3 ответов

У меня есть такой файл fasta: myfasta.fasta >1_CDS AAAAATTTCTGGGCCCCGGGGG AAATTATTA >2_CDS...

MAPK / 28 марта 2019
2 голосов
3 ответов

Я пытаюсь заменить все символы, которые не являются C, T, A или G на N в части последовательности...

mcfiston / 25 марта 2019
0 голосов
0 ответов

Я работаю над проектом по созданию библиотеки (на Java), которая может проверять различные...

Deepak Singh / 22 марта 2019
1 голос
1 ответ

У меня есть файл фаста, подобный этому: test_fasta.fasta >XXKHH_1 AAAAATTTCTGGGCCCC...

MAPK / 18 марта 2019
0 голосов
0 ответов
0 голосов
2 ответов

Я пытаюсь извлечь последовательности из мультифакторного файла с позиций 2 до 8 (семена микроРНК)....

Amaranta_Remedios / 11 марта 2019
0 голосов
1 ответ

У меня есть два файла данных (FASTA), и каждый файл представляет один ген, и последовательности...

Pedro Henrique / 08 марта 2019
Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...