Как не обрезать вывод моей белковой последовательности - PullRequest
0 голосов
/ 31 января 2019

Используя biopython, я проанализировал файл fasta, чтобы получить список последовательностей белка.Тем не менее, я могу получить только усеченную версию, поэтому, когда я пишу их в Excel, у меня нет всей последовательности белка (самая длинная последовательность составляет более 1000 остатков).Как я могу получить полную последовательность.Вот мой код (сокращенная версия):

from Bio import SeqIO
every=[]
length=[]    
for seq_record in SeqIO.parse("Y100.fasta.", "fasta"):   
   every.append (repr(seq_record.seq))   
   length.append (len(seq_record))    

print (every)
...