Нет другого способа установить прозрачность. Установка трехмерного объекта на слое видового экрана - это все равно что придать ему спрайт, с которым вы можете играть. Если у вас есть проблемы со слоями, я предлагаю создать слои для вас и другого контента. Выясните, что будет отображаться выше, и снизу ваш DAE, и создайте для них слои, но сложите их правильно. Взгляните на пост Энди Зупко о наслоении объектов. useOwnContainer создаст слой, но у вас не будет большого контроля над ним.
вот простой код для начала работы. Я использую BasicView, но вы понимаете, когда я использую область просмотра.
var daeLayer:ViewportLayer = new ViewportLayer(basicView.viewport,null);
basicView.viewport.containerSprite.addLayer(daeLayer);
basicView.viewport.containerSprite.sortMode = ViewportLayerSortMode.INDEX_SORT;
daeLayer.layerIndex = 1;
daeLayer.addDisplayObject3D(yourDAE);