Предполагая, что вы имеете в виду предварительную привязку данных, у вас есть (рваный) массив высот:
heights = {{1}, {1, 2}, {1, 2, 3}, {1, 2, 3, 4}, {1, 2, 3, 4, 5}}
Заполните массив в прямоугольную форму примерно так:
heights = PadRight[#, 5] & /@ heights
Определите, какие у вас границы бинов в каждом измерении (длина будет на один больше, чем количество бинов):
x = Range[1,6,1]
y = Range[1,11,2]
Дайте высоту как постоянную функцию:
Histogram3D[{{0, 0}}, {{x}, {y}}, heights &]
(Данные в первом аргументе являются поддельными, поскольку они фактически ни для чего не используются.)