Я использую SeqIO из пакета Biopython для преобразования файлов ab1 в файл fastq, и некоторые файлы получают неправильные оценки.на самом деле только один результат ("!")
SeqIO.convert('filename'+'.ab1', "abi", 'filename'+".fastq", "fastq")
пример результата:
@ filename GAACNGNCGCTGCCTATACTGCAAGTCGAGCGGACAGTAAGGGAGCTTGCTCCCGGATGTTAGCGGCGGACGGGT + !!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
Преобразование не работает ни в одной программе, поэтому проблема, похоже, в самих файлах.