Я пытаюсь получить DSSP файла PDB, но python выдает файл не найден.
Я скачал dssp из окна Ubuntu.
Вызов dssp в терминале ubuntu дает '/ usr / bin / dssp'
Вызов dssp с файлом pdb выдает правильный вывод.
Вполне возможно, что путь неверен в моем идеале.
p = PDB.PDBParser()
structure = p.get_structure(PDB_file[:-4].upper(), dir + "/" + PDB_file)
model = structure[0]
dssp=DSSP(model,PDB_file)
Три предыдущие строки работают нормально. я пытаюсь добавить dir (каталог) в конструктор безрезультатно