Извлек последовательность ДНК из хромосомы 1, благодаря функции subseq () и функции DNAString (из...

Допустим, у меня есть список непересекающихся геномных интервалов. chr1 1 100 chr1 101 200 chr1 201...

У меня есть следующий GenomicRanges объект, созданный с этим: library(GenomicRanges) gr <-...

Я хотел бы использовать foverlaps (), чтобы выполнить соединение с перекрывающимся диапазоном....

У меня есть таблица, подобная g1, я предпочитаю иметь области перекрытия, только если есть...

Этот простой код: library(GenomicRanges) GRanges(c("chr1", "chr1",...

У меня есть один объект GRanges с тысячами столбцов оценок ( tomap ), а другой - с интересующими...

Ошибка при попытке получить последовательность промотора из TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene с...

Быстрая версия - это то, что я хочу найти все совпадения на определенном расстоянии от определенных...

У меня есть объект GRanges (координаты всех генных экзонов);coding_pos определяет начальную позицию...

Я пытаюсь открыть файл Granges и хочу сохранить его под определенным именем, а не именем файла,...