Я относительно новичок в использовании плагина Cytoscape Reactome FI. Я определил дифференциально экспрессируемые гены у мышей (Mus musculus) между двумя интересующими меня экспериментальными условиями, используя анализ DESeq. Я могу sh определить пути, которые обогащены этими генами, которые экспрессируются по-разному. Я наткнулся на плагин Cytoscape Reactome FI, который находит пути и шаблоны сети, связанные с раком и другими типами заболеваний. Можно ли вводить гены мыши в Reactome для определения обогащенных путей?
Я не уверен, но я считаю, что сеть Reactome FI - это человек. Тем не менее, вы можете делать то, что вы хотите, используя stringApp, который также включает в себя возможность выполнять обогащение для многих видов, включая мышь.
- скутер