Что создает узел «контейнер» при объединении нескольких сетей в Cytoscape? - PullRequest
2 голосов
/ 21 февраля 2020

Я объединил 190 сетей, полученных из KEGG, используя Cytoscape. Объединенная сеть имеет узел под названием «контейнер», который очень сильно связан с несколькими другими узлами. Узел 'контейнер' не берется из исходных файлов пути. Что представляет этот узел и каково его значение? Attached is a screenshot showing the node 'container' in yellow

1 Ответ

1 голос
/ 05 марта 2020

Я почти уверен, что это не от инструмента слияния Cytoscape. Я думаю, что некоторые из ваших путей имеют «контейнерные» узлы, которые обертывают комплекс или группу генов. Во время слияния все они станут одним и тем же узлом. Даже если вы не видите «контейнерный» узел в сетевом представлении, проверьте, не появляется ли он где-нибудь в таблице узлов.

- scooter

...