Выберите все узлы, которые находятся на расстоянии 1 или 3 узла от интересующего гена - PullRequest
0 голосов
/ 27 января 2020

Я работаю с сетью, и в качестве фильтра я хотел бы сохранить только те гены, которые связаны с конкретным c геном.

Как выбрать только те гены, которые находятся на расстоянии максимум 2 или 3 узлов от одного узла?

Ty

1 Ответ

1 голос
/ 30 января 2020

Если вы выберете узел в сетевом представлении Cytoscape, а затем нажмете Control-6 (или Apple-6 на Ma c), вы выберете всех первых соседей этого узла. Сделайте это снова, чтобы выбрать всех первых соседей этих узлов, и вы выберете всех первых и вторых соседей исходного узла. То же самое можно сделать с помощью автоматизации Cytoscape (команды, RCy3 или py2cytoscape) и с помощью меню, используя Select-> Nodes-> Первые соседи выбранных узлов-> Undirected.

- scooter

...