Cytoscape 3.7.2 не работает в Ubuntu 19.10

Question

После обновления с Ubuntu 18.04 до Ubuntu 19.10 я не могу открыть предыдущие .cys файлы или использовать Cytoscape 3.7.2. Вот результат проверки скрипта. Это дало мне знать, что Cytoscape 3.7.2 и Ubuntu 19.10 не совместимы, и кажется, что это Java проблема. Кто-нибудь пытался это исправить? Спасибо

Answer 1

Я только что ответил на это в справочной службе Cytoscape. Для полноты вот что я предложил:

1. Попробуйте установить копию Java 8 откуда-нибудь. Наш опыт работы с OpenJDK 8 на Linux был несколько нечетким, но, кроме вещей, которые используют JavaFX, он, кажется, работает.
2. Обновите Java до OpenJDK 11 и попробуйте кандидата на выпуск Cytoscape 3.8. Есть некоторые известные ошибки, так что это не будет окончательная версия, но она, безусловно, работает для большинства вещей. Вы можете найти кандидата на релиз здесь: https://cytoscape-builds.ucsd.edu/cytoscape-builds/Cytoscape-3.8.0/3.8.0-Release-Candidate-2/

- скутер