Настройка Eclipse для разработки плагинов Cytoscape в Windows - PullRequest
1 голос
/ 06 сентября 2011

Позвольте мне начать с того, что я не очень опытный программист и был бы очень признателен, если бы вы могли полностью указать любые шаги, которые вы могли бы иначе пропустить, упомянув.

В настоящее время я нахожусь на начальных этапах разработки плагинов.для Cytoscape, я создал проект Java в Eclipse и сделал следующее

  1. Я добавил cytoscape.jar в качестве внешней библиотеки

  2. Iдобавили "-p C: \ Program Files \ Cytoscape_v2.8.1 \ plugins" на вкладке аргументов в разделе "Аргументы программы"

Когда я пытаюсь запустить плагин, он загружает Cytoscape, но без каких-либоустановленные плагины (0 плагинов в менеджере плагинов), кроме того, он также имеет свернутые пункты меню (не может импортировать определенные файлы, эти опции просто больше не существуют)

Я подозреваю, что это потому, что мне нужно включить больше файлов jar каквнешние библиотеки, однако я не уверен, какие именно.

Я использую Eclipse Indigo и Cytoscape 2.8.1.

Не знаюНе думаю, что это проблема с кодом плагина, поскольку я использовал исходный код существующего плагина в качестве тестового плагина.

Спасибо за ваше терпение и время.

Sudipto

PS: я уже посмотрел на следующее без особого успеха http://cytoscape.wodaklab.org/wiki/SettingUpEclipseForPluginDevelopment

1 Ответ

1 голос
/ 13 сентября 2011

Разобрался с проблемой, не заметил пробела в пути к моему плагину, кавычки решили всю проблему.

Кроме того, вы должны установить и местоположение jar-файла ВАШЕГО проекта, и плагинов,С eclipse это может быть не совсем понятно, потому что направления для eclipse немного отличаются от направлений для netbeans .

Так что если вы экспортируете свой jar в / workspace,и у вас есть cytoscape в /Applications/Cytoscape_v2.8.3 (OS X), затем поместите следующее в конфигурацию выполнения в виде двух отдельных строк:

-p "/Applications/Cytoscape_v2.8.3/plugins" 
-p "/workspace/jar_file_export_folder" 
...