В XNA 2.0 я вспомнил, что для указания прозрачности цвета в окнах свойств вашего JPEG было задано свойство. Сейчас я нахожусь в XNA 3.0 и больше не нахожу это свойство! Есть идеи?
Свойство цветового ключа все еще там. Проверьте эту страницу XNA Docs , возможно, это поможет.