Как я могу открыть файл cytoscape через cyrest в python? - PullRequest
1 голос
/ 08 апреля 2019

В настоящее время я работаю с Cytoscape и создал некоторый файл сеанса. Затем я хотел бы получить доступ к этому файлу в python и получить его результат в виде изображения - особенно мне хотелось бы отсортировать его по какому-то определенному общему имени, когда я запрашиваю результат, что означает, что результат изменяется до слова сортировки. Спасибо.

1 Ответ

0 голосов
/ 11 апреля 2019

Существует библиотека Python, которая облегчает работу с CyREST в Python. Вы должны иметь возможность делать практически все, что вы можете делать в Cytoscape из Python. Вот руководство: https://py2cytoscape.readthedocs.io/en/latest/

А вот некоторые шаги, которые вы ищете:

  • cyclient.session.open ()
  • cyclient.network.list ()
  • cyclient.view.export ()
...