Мы работаем с базой данных карты соединений (www.clue.io).На этом сайте вы можете скачать ген экспрессии (среди других вариантов) различных экспериментов.
Проблема заключается в том, что для одного эксперимента ген помечается ссылкой affymetrix, а в другом - именем ENTREZ и HUGO.У нас возникли проблемы при объединении этих двух разных аннотаций.
Мы пытались решить эту проблему с помощью пакета biomart R.