У меня есть вывод RNA-seq reads из CLC genomics workbench, для Arabidopsis thaliana.Список генов...
У меня есть список из 3000 символов гена.Я хочу знать их генные имена в ансамбле.напр. RALBP1 SENP5...
У меня есть этот код (от здесь ): library('biomaRt') mart <-...
Я пытаюсь установить пакет Biomart, и я использовал этот код: source("https://bioconductor
Мы работаем с базой данных карты соединений (www.clue.io).На этом сайте вы можете скачать ген...
Я скачал обширный набор данных из NIH GEO и пытаюсь преобразовать имена Ensembl в первом столбце в...
Я пытаюсь преобразовать список имен генов в идентификаторы генов entrez. на данный момент у меня...
Я унаследовал набор данных выходных данных RNAseq от Canis Lupus (собака). У меня есть...
Я извлек из некоторых текстов информацию о генах и хромосомах в объекте, чтобы классифицировать...
Используя Biomart, я смог извлечь образцы проситов для списка генов для нескольких видов. например,...
У меня есть два набора данных ниже: df <- read.table(text = "Human_Gene_Name hsapiens...
Мои данные выглядят так: df <- read.table(header = T, text = "GeneID Gene_Name Species...
Я хочу получить гены, которые присутствуют в ряде регионов. Скажем, у меня есть файл постели с...
Ранее я задавал похожий вопрос о том, как считать уникальные значения из фрейма данных, но мне...
Я использовал lapply вместе с biomart для извлечения гомологов для 3 разных видов. Мне также нужно...
Я недавно задал вопрос о lapply, но теперь я изменил свой подход и столкнулся с большим количеством...
Я пытаюсь использовать lapply для изменения названия вида при извлечении всех человеческих генов. Я...
Ниже приведена небольшая часть моего кода: library(biomaRt) ensembl_hsapiens <-...