Вопросы с тегом biomart - PullRequest

Вопросы с тегом biomart

0 голосов
1 ответ

У меня есть вывод RNA-seq reads из CLC genomics workbench, для Arabidopsis thaliana.Список генов...

James Fischer / 12 мая 2019
0 голосов
0 ответов

У меня есть список из 3000 символов гена.Я хочу знать их генные имена в ансамбле.напр. RALBP1 SENP5...

john / 14 апреля 2019
1 голос
1 ответ

У меня есть этот код (от здесь ): library('biomaRt') mart <-...

Adam Bellaïche / 15 марта 2019
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь установить пакет Biomart, и я использовал этот код: source("https://bioconductor

Greg Rov / 01 марта 2019
0 голосов
0 ответов

Мы работаем с базой данных карты соединений (www.clue.io).На этом сайте вы можете скачать ген...

JuanFerrer / 20 декабря 2018
0 голосов
1 ответ

Я скачал обширный набор данных из NIH GEO и пытаюсь преобразовать имена Ensembl в первом столбце в...

MickeyP / 20 ноября 2018
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь преобразовать список имен генов в идентификаторы генов entrez. на данный момент у меня...

Laurent Winckers / 16 ноября 2018
0 голосов
1 ответ

Я унаследовал набор данных выходных данных RNAseq от Canis Lupus (собака). У меня есть...

Ryan T. / 30 августа 2018
0 голосов
0 ответов

Я извлек из некоторых текстов информацию о генах и хромосомах в объекте, чтобы классифицировать...

aida abidi / 27 августа 2018
0 голосов
0 ответов

Используя Biomart, я смог извлечь образцы проситов для списка генов для нескольких видов. например,...

Jack Dean / 06 июня 2018
0 голосов
2 ответов

У меня есть два набора данных ниже: df <- read.table(text = "Human_Gene_Name hsapiens...

Jack Dean / 10 мая 2018
0 голосов
1 ответ
0 голосов
2 ответов

Я хочу получить гены, которые присутствуют в ряде регионов. Скажем, у меня есть файл постели с...

Emilio Mármol Sánchez / 02 мая 2018
0 голосов
2 ответов

Ранее я задавал похожий вопрос о том, как считать уникальные значения из фрейма данных, но мне...

Jack Dean / 01 мая 2018
0 голосов
1 ответ

Я использовал lapply вместе с biomart для извлечения гомологов для 3 разных видов. Мне также нужно...

Jack Dean / 29 апреля 2018
0 голосов
1 ответ

Я недавно задал вопрос о lapply, но теперь я изменил свой подход и столкнулся с большим количеством...

Jack Dean / 26 апреля 2018
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь использовать lapply для изменения названия вида при извлечении всех человеческих генов. Я...

Jack Dean / 26 апреля 2018
0 голосов
1 ответ

Ниже приведена небольшая часть моего кода: library(biomaRt) ensembl_hsapiens <-...

Jack Dean / 24 апреля 2018
Для получения более полной информации посмотрите в списке вопросов или в популярных тегах.
Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...