Вопросы с тегом biopython - PullRequest

Вопросы с тегом biopython

0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь установить biopython в Jupyter Notebook, Anaconda, Ubuntu 16.04.Я следую процедуре на...

Simon / 21 марта 2019
0 голосов
0 ответов

Есть ли способ, которым я могу преобразовать строку ввода пользователя в объект byopython Seq? Я...

Paulo Sergio Schlogl / 20 марта 2019
1 голос
1 ответ

У меня проблема с загрузкой полной записи из Nucleotide db. Я использую: from Bio import Entrez...

Some student / 20 марта 2019
0 голосов
0 ответов

У меня есть древовидные объекты в процессе: Словарь (chimera), который содержит один ключ (the...

chippycentra / 20 марта 2019
0 голосов
1 ответ

У меня возникли проблемы с подключением каждой команды с помощью BioPython. Может ли кто-нибудь...

kaihami / 19 марта 2019
0 голосов
1 ответ

Python новенький здесь.Я хочу скачать последовательность генома для генома (NC_007779.1), используя...

Voronin_10 / 14 марта 2019
1 голос
1 ответ

У меня проблема с моим кодом.Я пытаюсь перебрать список генов файла genbank с помощью BioPython.Вот...

CelineDion / 12 марта 2019
0 голосов
2 ответов

Я пытаюсь извлечь последовательности из мультифакторного файла с позиций 2 до 8 (семена микроРНК)....

Amaranta_Remedios / 11 марта 2019
1 голос
1 ответ

У меня есть файл fasta, который содержит несколько сотен записей, но я пытаюсь вернуть таблицу...

L. Seu / 06 марта 2019
0 голосов
0 ответов

Я разрабатываю веб-приложение на удаленном сервере и не могу найти способ импортировать Biopython...

Pau B / 03 марта 2019
0 голосов
1 ответ

В python этот код, где я непосредственно вызываю функцию SeqIO.parse (), работает нормально: from...

Abraham Ahmad / 21 февраля 2019
0 голосов
1 ответ

Я пишу csv-ридер для генерации файлов Genbank для записи аннотаций с последовательностью. Сначала я...

JoeT / 21 февраля 2019
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь решить одну из задач Розалинды, и я не могу найти способ извлечь данные в течение...

Yuriy Laivins / 13 февраля 2019
0 голосов
2 ответов

У меня есть следующий код, который читает файл FASTA с 10 последовательностями генов и возвращает...

DataLearner555 / 08 февраля 2019
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь запустить попарный взрыв между двумя последовательностями в скрипте Python и с помощью...

user5625577 / 07 февраля 2019
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь использовать NcbitblastnCommandline, чтобы взорвать запрос белка против нуклеотидной...

Wendy / 07 февраля 2019
0 голосов
1 ответ

Я пишу сценарий, который может заменить все экземпляры аминокислотного остатка в столбце файла...

Reza Rezaei / 01 февраля 2019
0 голосов
1 ответ

Я хочу получить все статьи в определенном журнале, которые связаны с определенным термином / темой....

Damiano Grignolio / 31 января 2019
0 голосов
0 ответов

Используя biopython, я проанализировал файл fasta, чтобы получить список последовательностей белка

Gaibo Yan / 31 января 2019
0 голосов
1 ответ

Я хочу найти IUPAC, эквивалентный 2 различным нуклеотидам. Пример: у меня есть A и C, и я хочу M....

Liad / 25 января 2019
0 голосов
2 ответов

Я работал над программой, которая требует подсчета подстрок (до 4000 подстрок из 2-6 символов,...

Daniel Stueckmann / 24 января 2019
0 голосов
2 ответов

Я новичок и начал кодировать в Pyhton в последние несколько месяцев. У меня есть скрипт, который...

Ahmed Magdy Moustafa / 16 января 2019
0 голосов
1 ответ

Ссылка на проблему http://rosalind.info/problems/ini2/ Дано: два натуральных числа a и b, каждое...

Starim / 15 января 2019
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь отредактировать файл MSA (Multiple Sequence Alignment), созданный ClustalW, чтобы...

Shred / 08 января 2019
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь использовать BioPython для получения нуклеотидных последовательностей путем ввода номера...

Shengyuan Wang / 28 декабря 2018
Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...