Вопросы с тегом biopython - PullRequest

Вопросы с тегом biopython

0 голосов
1 ответ

Мне нужно прочитать файл fasta, загруженный в хранилище Cloud Object с использованием Biopython.У...

Dani / 03 октября 2018
0 голосов
5 ответов

Мне было интересно, есть ли способ получить последовательность белков из идентификаторов белков...

AST / 29 сентября 2018
0 голосов
1 ответ

У меня большой выходной файл BLAST (outfmt 6).Я заинтересован в поиске взаимных гомологов в этом...

Gloom / 22 сентября 2018
0 голосов
1 ответ

Я могу получить прямой доступ к остатку белка 1n31, используя: residue =...

bioinfoLearn / 20 сентября 2018
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь установить функцию monkeypatch во внешнем модуле, который я использую, но monkeypatch не...

ipetrik / 19 сентября 2018
0 голосов
0 ответов

Я импортировал файл Newick с комментариями и хотел бы экспортировать его в PhyloXML с комментариями

user3798465 / 14 сентября 2018
0 голосов
1 ответ

В кулинарной книге биопиона я не мог найти, как на самом деле запустить clustalw.Я сделал то, что...

Gufran GUNGOR / 12 сентября 2018
0 голосов
1 ответ

Недавно я пытался использовать максимальное правдоподобие для создания деревьев из файла...

Nicolas / 08 сентября 2018
0 голосов
1 ответ

Я понимаю, что это старый вопрос, но я обновляю его в надежде, что мой вопрос будет яснее. Я...

Ben Oppenheimer / 03 сентября 2018
0 голосов
2 ответов

Я получаю SyntaxError: неверный синтаксис при попытке установить biopython с помощью следующей...

Jaswant S / 31 августа 2018
0 голосов
0 ответов

Я хотел бы посоветовать обойти ошибку разбора XML. В моем выводе BLAST xml у меня есть описание с...

Courtney Stairs / 05 июля 2018
0 голосов
4 ответов

Я хочу сделать код, который считает все триплеты в последовательности. Пока я прочитал много постов...

Miguel A. Friginal / 03 июля 2018
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь запустить попарно метод глобального выравнивания в biopython в цикле для примерно 10000...

Amrith Krishna / 30 июня 2018
0 голосов
1 ответ

Я применяю пользовательский метод к кадру данных, используя метод apply. Когда передается...

Amrith Krishna / 30 июня 2018
0 голосов
1 ответ

Я запустил pip3 install biopython и, похоже, он был установлен правильно Но когда я пытаюсь...

Andre Fu / 27 июня 2018
0 голосов
1 ответ
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь адаптировать скрипт (найден здесь: https://gist.github

Lsds9 / 12 июня 2018
0 голосов
1 ответ

У меня большой текстовый файл (разделенный "|"), как в этом небольшом примере: >ENST00000511961

user3631908 / 11 июня 2018
0 голосов
1 ответ

Мне интересно знать индекс остатков, которые соответствуют строке, используя pairwise2 в python....

kdba / 04 июня 2018
0 голосов
1 ответ

Я использую приведенный ниже код для выполнения esearch , но идентификаторы, которые я получаю из...

Chahna Patel / 04 июня 2018
0 голосов
3 ответов

У меня есть текстовый файл, подобный этому небольшому примеру: >ENST00000491024

john / 30 мая 2018
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь получить доступ к списку организмов из типа хордовых, которые секвенировали хромосомы из...

Chahna Patel / 29 мая 2018
0 голосов
1 ответ

Я пишу скрипт, который перенумеровывает структуры белка (файлы CIF), а затем сохраняет их (файлы...

Janne B / 29 мая 2018
0 голосов
2 ответов

Я создал небольшую программу для извлечения выбранных идентификаторов + последовательности из файла...

Ana / 24 мая 2018
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь импортировать модули Biopython на моем терминале Mac, но выдает следующую ошибку.Будет...

Ambuj Kumar / 24 мая 2018
Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...