Мне нужно прочитать файл fasta, загруженный в хранилище Cloud Object с использованием Biopython.У...

Мне было интересно, есть ли способ получить последовательность белков из идентификаторов белков...

У меня большой выходной файл BLAST (outfmt 6).Я заинтересован в поиске взаимных гомологов в этом...

Я могу получить прямой доступ к остатку белка 1n31, используя: residue =...

Я пытаюсь установить функцию monkeypatch во внешнем модуле, который я использую, но monkeypatch не...

Я импортировал файл Newick с комментариями и хотел бы экспортировать его в PhyloXML с комментариями

В кулинарной книге биопиона я не мог найти, как на самом деле запустить clustalw.Я сделал то, что...

Недавно я пытался использовать максимальное правдоподобие для создания деревьев из файла...

Я понимаю, что это старый вопрос, но я обновляю его в надежде, что мой вопрос будет яснее. Я...

Я получаю SyntaxError: неверный синтаксис при попытке установить biopython с помощью следующей...

Я хотел бы посоветовать обойти ошибку разбора XML. В моем выводе BLAST xml у меня есть описание с...

Я хочу сделать код, который считает все триплеты в последовательности. Пока я прочитал много постов...

Я пытаюсь запустить попарно метод глобального выравнивания в biopython в цикле для примерно 10000...

Я применяю пользовательский метод к кадру данных, используя метод apply. Когда передается...

Я запустил pip3 install biopython и, похоже, он был установлен правильно Но когда я пытаюсь...

У меня есть некоторый код, который удаляет название вида из списка с подчеркиванием в формат,...

Я пытаюсь адаптировать скрипт (найден здесь: https://gist.github

У меня большой текстовый файл (разделенный "|"), как в этом небольшом примере: >ENST00000511961

Мне интересно знать индекс остатков, которые соответствуют строке, используя pairwise2 в python....

Я использую приведенный ниже код для выполнения esearch , но идентификаторы, которые я получаю из...

У меня есть текстовый файл, подобный этому небольшому примеру: >ENST00000491024

Я пытаюсь получить доступ к списку организмов из типа хордовых, которые секвенировали хромосомы из...

Я пишу скрипт, который перенумеровывает структуры белка (файлы CIF), а затем сохраняет их (файлы...

Я создал небольшую программу для извлечения выбранных идентификаторов + последовательности из файла...

Я пытаюсь импортировать модули Biopython на моем терминале Mac, но выдает следующую ошибку.Будет...