Вопросы с тегом biopython - PullRequest

Вопросы с тегом biopython

0 голосов
1 ответ

У меня проблемы с печатью вида из моих файлов фаста Входной файл такой: >NP_842573.1 chromosomal...

Biomage / 23 мая 2018
0 голосов
1 ответ

У меня на самом деле есть такие файлы: >seq1:QXQXQWQ:XQWQ ACTG >seq3:WCCWHWJ:WGH ATGC...

Grendel / 18 мая 2018
0 голосов
2 ответов

Обычный файл fasta с длиной чтения 120 nt: 'single_mapped.fa' Файл CSV содержит 10000 20-метров и...

Yucheng Wang / 15 мая 2018
0 голосов
2 ответов

У меня на самом деле есть огромный файл multitifasta seq, такой: >Seq_1_0035_0035 ATTGGAT...

Grendel / 15 мая 2018
0 голосов
1 ответ

Мне интересно, как Bio.PDB идентифицирует остаток как гетеро-остаток. Я знаю, что метод Остаток.ид...

M. Iyer / 09 мая 2018
0 голосов
1 ответ

Я несколько озадачен странным поведением в библиотеке difflib. Я пытаюсь найти перекрывающиеся...

Mr. T / 05 мая 2018
0 голосов
1 ответ

У меня проблемы с сохранением данных в CSV-файл. Я пытаюсь разделить аминокислоты в этом гене на...

Wade / 02 мая 2018
0 голосов
1 ответ

У меня есть идентификатор PubMed тезисов, например, 10748870. Я хотел бы получить дату публикации...

mpourreza / 02 мая 2018
0 голосов
1 ответ

В настоящее время я работаю над проектом класса, который требует от меня извлечения данных с...

pmramos / 01 мая 2018
0 голосов
1 ответ

Я пытался прочитать последовательность фаста, но почему-то она всегда пропускает последнюю...

nvnvashisth / 01 мая 2018
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь автоматизировать бластные выходы из нескольких файлов в каталоге. Переменные здесь жестко...

Learning2programme / 27 апреля 2018
0 голосов
1 ответ

У меня есть файл с несколькими именами, такими: seq1 seq9 seq3 seq7 seq5 seqi seqn.... и другой...

Grendel / 24 апреля 2018
0 голосов
1 ответ

То, что я хотел бы сделать, это сделать все непоследовательные последовательности записи GenBank в...

Jasper / 12 марта 2012
3 голосов
1 ответ

Как я могу это сделать? Я использую Biopython и уже видел руководство. Конечно, я могу сделать...

user1218225 / 18 февраля 2012
1 голос
3 ответов

Я новый пользователь Python и попытался импортировать файлы в формате genbank и fasta.В своей...

modi2020 / 12 февраля 2012
0 голосов
2 ответов

Я хочу вычислить все три двугранных угла в остатке. calc_dihedral(atom1, atom2, atom3, atom4)...

user1144004 / 11 февраля 2012
1 голос
2 ответов

from Bio.PDB import * parser=PDBParser() structure=parser.get_structure('cal1','3CLN

user1144004 / 05 февраля 2012
0 голосов
1 ответ

У меня есть файл gb, и мне нужно извлечь из него некоторые специфические особенности: названия и...

ifreak / 03 февраля 2012
1 голос
1 ответ

Я столкнулся с ошибкой, которую не могу устранить. Я пытаюсь выполнить самый простой набор команд,...

user1158803 / 19 января 2012
1 голос
2 ответов

Итак, я работаю над проблемой, когда мне приходится находить различные повторения строк после...

dhillonv10 / 11 января 2012
1 голос
1 ответ

У меня есть набор (белковых) последовательностей, которые были найдены с помощью программного...

hari / 02 января 2012
1 голос
1 ответ

Я написал этот варварский скрипт для создания перестановок строки символов, которые содержат n (до...

jhjudd / 14 декабря 2011
0 голосов
4 ответов

из строки скажем dna = 'ATAGGGATAGGGAGAGAGCGATCGAGCTAG' у меня есть подстрока скажем dna.format =...

Viv_bio / 05 декабря 2011
2 голосов
1 ответ

Например, если у меня есть строка 'ATGAGGGATAGAGGGTTGGGAGAGATGGATAGGGGATAGATTG', я должен получить...

Viv_bio / 05 декабря 2011
1 голос
2 ответов

Я пытаюсь проанализировать файл fasta в Biopython, используя следующий код. Как я могу решить эту...

saraswathi / 05 ноября 2011
Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...