Вопросы с тегом biopython - PullRequest

Вопросы с тегом biopython

0 голосов
3 ответов

учитывая текстовый файл FASTA (Rosalind_gc.txt), я должен пройти через каждую запись ДНК и...

Thomas William Dunn / 30 мая 2019
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь извлечь местоположение гена из файла fasta с помощью BioPython, но функция .location не...

m.n.m / 28 мая 2019
1 голос
4 ответов

У меня есть файл с несколькими строками в формате FASTA, который я хочу разбить на части и...

Tim Stack / 24 мая 2019
0 голосов
2 ответов

Я хочу преобразовать файл .csv в файл GFF3.CSV-файл содержит данные аннотации.Я знаю, что мне нужно...

eli bio67 / 17 мая 2019
0 голосов
0 ответов

Я пытался запустить clustalw из библиотеки Python3 Biopython на Google Cloud Platform, а затем с...

Hang Lin / 14 мая 2019
0 голосов
1 ответ

Я пользователь ubuntu и запускаю много скриптов, написанных на python3, который был установлен...

Laura Hernández Javier / 13 мая 2019
0 голосов
0 ответов

Мне нужно перевести выровненные последовательности ДНК с помощью биопиона from Bio.Seq import Seq...

Yeping Sun / 04 мая 2019
0 голосов
1 ответ

Мне нужно выяснить, в каких белках моего набора данных находится этот аминокислотный мотив:...

Osedax / 30 апреля 2019
0 голосов
0 ответов

PyCharm установлен и работает.Пакет Biopython загружен и открыт в PyCharm. pip install biopython...

Jose Alejandro Estrella / 29 апреля 2019
3 голосов
1 ответ

Я довольно новичок в Python и пытаюсь разбить текстовый файл, где записи состоят из двух строк в...

Ludolph314 / 25 апреля 2019
0 голосов
0 ответов

Я пытаюсь написать код, который автоматически извлекает файл tsv, содержащий начальную и конечную...

elissar-nd / 24 апреля 2019
0 голосов
1 ответ

У меня есть файл fasta (fasta - это файл, в котором строка заголовка начинается с >, за которым...

MAPK / 18 апреля 2019
1 голос
0 ответов

Я написал приложение Django для запроса базы данных Pubmed с помощью инструмента Entrez,...

ditori / 15 апреля 2019
1 голос
0 ответов

Я пытаюсь извлечь информацию из мультифаст-файла (например, C / G / A / T count, CG%), используя...

egeorgia / 11 апреля 2019
1 голос
1 ответ

У меня горит идентификатор гена: id_list = ["19304878", "18606172", "16403221", "16377612",...

lucaspompeun / 10 апреля 2019
1 голос
1 ответ

Я работаю над попыткой автоматизировать некоторые поиски BLAST. Мне нужно выбрать только три первых...

AccidentalCube / 08 апреля 2019
2 голосов
0 ответов

У меня есть файл PDB, затем я преобразую его в файл, который дает двугранные углы. Но теперь я...

Paresh Meal / 06 апреля 2019
1 голос
0 ответов

Я пытаюсь получить DSSP файла PDB, но python выдает файл не найден. Я скачал dssp из окна Ubuntu....

user3555068 / 05 апреля 2019
0 голосов
0 ответов

Я пытаюсь объявить объект парсера PDB, но объект не создается. Я показываю метод, где это проблема...

user3555068 / 04 апреля 2019
0 голосов
1 ответ

Я хочу вернуть n-ю базовую пару, учитывая мой ввод в геном fna.gz. Теоретически это будет работать...

Blake Young / 02 апреля 2019
1 голос
0 ответов

Я новичок в кодировании в целом.Мне нравится использовать Sublime Text 3, но я столкнулся с...

lambda_xx / 02 апреля 2019
0 голосов
0 ответов

Я делаю программу прогнозирования белка на основе геномных данных, и в какой-то момент мне нужно...

Corentin M. / 29 марта 2019
0 голосов
1 ответ

У меня есть данные последовательности ДНК. Например, X="ACGGGT" Y="ACGGT" Я...

Tom_Hanks / 24 марта 2019
0 голосов
1 ответ

Прежде всего, я хочу сказать, что я новичок в программировании.У меня есть 2 zip-файла (каждый из...

KGee / 23 марта 2019
0 голосов
1 ответ

Я использую Biopython для обработки некоторых данных NGS.Но я сталкиваюсь со странной проблемой,...

Sidi Ma / 21 марта 2019
Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...