учитывая текстовый файл FASTA (Rosalind_gc.txt), я должен пройти через каждую запись ДНК и...
Я пытаюсь извлечь местоположение гена из файла fasta с помощью BioPython, но функция .location не...
У меня есть файл с несколькими строками в формате FASTA, который я хочу разбить на части и...
Я хочу преобразовать файл .csv в файл GFF3.CSV-файл содержит данные аннотации.Я знаю, что мне нужно...
Я пытался запустить clustalw из библиотеки Python3 Biopython на Google Cloud Platform, а затем с...
Я пользователь ubuntu и запускаю много скриптов, написанных на python3, который был установлен...
Мне нужно перевести выровненные последовательности ДНК с помощью биопиона from Bio.Seq import Seq...
Мне нужно выяснить, в каких белках моего набора данных находится этот аминокислотный мотив:...
PyCharm установлен и работает.Пакет Biopython загружен и открыт в PyCharm. pip install biopython...
Я довольно новичок в Python и пытаюсь разбить текстовый файл, где записи состоят из двух строк в...
Я пытаюсь написать код, который автоматически извлекает файл tsv, содержащий начальную и конечную...
У меня есть файл fasta (fasta - это файл, в котором строка заголовка начинается с >, за которым...
Я написал приложение Django для запроса базы данных Pubmed с помощью инструмента Entrez,...
Я пытаюсь извлечь информацию из мультифаст-файла (например, C / G / A / T count, CG%), используя...
У меня горит идентификатор гена: id_list = ["19304878", "18606172", "16403221", "16377612",...
Я работаю над попыткой автоматизировать некоторые поиски BLAST. Мне нужно выбрать только три первых...
У меня есть файл PDB, затем я преобразую его в файл, который дает двугранные углы. Но теперь я...
Я пытаюсь получить DSSP файла PDB, но python выдает файл не найден. Я скачал dssp из окна Ubuntu....
Я пытаюсь объявить объект парсера PDB, но объект не создается. Я показываю метод, где это проблема...
Я хочу вернуть n-ю базовую пару, учитывая мой ввод в геном fna.gz. Теоретически это будет работать...
Я новичок в кодировании в целом.Мне нравится использовать Sublime Text 3, но я столкнулся с...
Я делаю программу прогнозирования белка на основе геномных данных, и в какой-то момент мне нужно...
У меня есть данные последовательности ДНК. Например, X="ACGGGT" Y="ACGGT" Я...
Прежде всего, я хочу сказать, что я новичок в программировании.У меня есть 2 zip-файла (каждый из...
Я использую Biopython для обработки некоторых данных NGS.Но я сталкиваюсь со странной проблемой,...