Вопросы с тегом biopython - PullRequest

Вопросы с тегом biopython

0 голосов
3 ответов

Мне нужно получить тот же вывод, полученный с помощью следующего кода, но без использования...

AT-User / 26 декабря 2018
0 голосов
1 ответ
0 голосов
1 ответ

Для назначения мне нужно написать код, который переводит последовательность РНК из файла фаста в...

S. D. / 22 декабря 2018
0 голосов
2 ответов

У меня большой текстовый файл, подобный этому примеру: пример: >chr9:128683-128744...

user10657934 / 21 декабря 2018
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь открыть и прочитать файл fasta и использовать только первую строку из ввода.В настоящее...

Ellie Clark / 21 декабря 2018
0 голосов
0 ответов

Я хотел бы изменить библиотеку editdistance. для примера: на расстоянии редактирования или на...

faiaz000 / 17 декабря 2018
0 голосов
0 ответов

Мне нужно перевести несколько однозначных последовательностей РНК, представленных в одном файле...

Glenn Moore / 13 декабря 2018
0 голосов
1 ответ

У меня есть много файлов xml для анализа данных, которые я использую с помощью python. Например,...

Lc_decg / 13 декабря 2018
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь запустить скрипт Python для рисования последовательностей из отдельного файла (merged

JTrew / 11 декабря 2018
0 голосов
0 ответов

Я пытаюсь создать скрипт на python, где пользователь может ввести свой файл FASTA, и этот файл...

temsandroses / 02 декабря 2018
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь создать программу, использующую python, которая будет вводить пользовательский файл fasta...

temsandroses / 02 декабря 2018
0 голосов
0 ответов

Используя пакет Phylo в Python3, я пытаюсь вычислить расстояния между двумя конечными узлами...

SamAln / 26 ноября 2018
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь запустить скрипт Python для рисования последовательностей из отдельного файла (merged

JTrew / 26 ноября 2018
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь импортировать матрицу замещения для реализации алгоритма Нидлмана-Вунша в Python на...

NewtonsGate / 25 ноября 2018
0 голосов
0 ответов
0 голосов
1 ответ

Я пишу код для преобразования выравнивания из нескольких файлов в формат phylip, а затем вывод всех...

Lola / 06 ноября 2018
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь собрать список опубликованных статей, используя biopython entrez. Я хочу собрать...

El David / 06 ноября 2018
0 голосов
1 ответ

Мой текущий многострочный файл fasta таков: >chr1|chromosome:Mt4.0v2:1:1:52991155:1 ATGC......

Nicole / 04 ноября 2018
0 голосов
1 ответ

Я новичок в python / biopython и попробовал взорвать, используя biopython, например: from Bio.Blast...

Peiran / 03 ноября 2018
0 голосов
1 ответ

Мне нужно проанализировать файл PDB, используя biopython, чтобы извлечь каждую строку, которая...

flannel_bioinformatician / 01 ноября 2018
0 голосов
1 ответ

Мне нужно преобразовать контиги в соответствующие им последовательности белков с учетом эталонного...

Thomas / 21 октября 2018
0 голосов
0 ответов

Я хотел бы получить интронные последовательности некоторых генов (например, https://www.ncbi.nlm

Malj90 / 11 октября 2018
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь перебрать большой файл fasta с SeqIO.parse, но у меня возникли некоторые проблемы.Вот мой...

francoiskroll / 10 октября 2018
0 голосов
1 ответ

Для простоты использования и совместимости с другим нисходящим конвейером я пытаюсь изменить имена...

Gunther / 10 октября 2018
0 голосов
2 ответов

В файле у меня есть несколько символов для замены. letters = ["B", "Z", "J", "U", "O"] for record...

F.Lira / 09 октября 2018
Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...