У меня есть список ок.4400 номеров доступа (белков) хранятся в виде столбца данных.Не все эти...

Я на самом деле пытаюсь загрузить все последовательности вирусных белков, доступные в базе данных...

Я пытаюсь установить ncbi-blast + с базой данных SwissProt, используя anaconda.Я уже установил...

Я пытаюсь получить доступ к данным последовательности белка из NCBI в R, используя функцию read

Я использую этот сценарий: import csv import time import sys from ete3 import NCBITaxa ncbi =...

Я пытаюсь загрузить файл fasta из NCBI по следующему конвейерному протоколу на основе Perl: esearch...

Я пытаюсь написать сценарий, который будет проходить через все каталоги в каталоге, где он будет...

Я должен найти в NCBI идентификатор CAA37914 и загрузить файл fasta с помощью wget на ubuntu-18.04...

У меня есть цикл bash, который использует программу на python для циклического перебора каждого...

У меня есть некоторый код, который удаляет название вида из списка с подчеркиванием в формат,...

Я пытаюсь адаптировать скрипт (найден здесь: https://gist.github

Я хочу загрузить файл MEDLINE из NCBI PubMed с использованием скрипта Python.Это шаги, которые я...

У меня есть метод для чтения файла Newick и возврата строки в инфраструктуре Django, который...

Я пытаюсь получить доступ к списку организмов из типа хордовых, которые секвенировали хромосомы из...

Я недавно скачал кучу файлов sra.и мне нравится конвертировать их в парные чтения fastq.Это...

Можно ли преобразовать pmc-идентификаторы (опубликованные центральные идентификаторы) в pmids...

Я пытаюсь сгенерировать файлы, обрабатывающие службы SOAP, описанные здесь: http://www.ncbi.nlm.nih

Я пытаюсь использовать SimpleXML для чтения некоторых выводов NCBI BLAST XML, и я могу получить...

Я хочу получить 10 лучших последовательностей результатов BLAST (только последовательности, без...

Обновление: ссылка в ответе интересна и полезна, но, к сожалению, не учитывает необходимость API...

Я пытаюсь найти файл gene_info с названиями генов и расположением хромосом.Тем не менее, я не могу...

Я пытаюсь получить следующий URL-адрес с помощью функции downloadURL следующим образом: http://www

Я пытаюсь извлечь только первый удар из файла NCBI xml BLAST. Далее хотелось бы получить только...

Я построил пользовательский интерфейс, это как поисковая система для BioProcess / Disease -> Genes....