Итак, я обнаружил, что blender устанавливает непрозрачность в материалах на 0. Вы можете изменить это обратно с помощью этого кода:
Model model = modelLoader.loadModel(Gdx.files.getFileHandle(path, Files.FileType.Internal));
for (Material m : model.materials) {
m.set(new BlendingAttribute(GL20.GL_SRC_ALPHA, GL20.GL_ONE_MINUS_SRC_ALPHA));
}