Вопросы с тегом bioperl - PullRequest

Вопросы с тегом bioperl

1 голос
0 ответов

Я использую conda для установки нескольких пакетов. Я уже установил Perl под conda, и он работает...

Andrés Parada / 08 октября 2019
0 голосов
1 ответ

При попытке прочитать файл SCF я получил ошибку ошибки сегментации (ядро выгружено). Я использую...

Yushin Jung / 08 октября 2019
0 голосов
2 ответов

У меня есть 2 CSV и текстовые файлы, файл 1 имеет 2 столбца, один с идентификатором гена и два с...

Mutua Mwikali / 22 мая 2019
1 голос
1 ответ

Я пытаюсь установить модуль Perl Bio :: Tools :: Run :: Alignment :: Muscle.Я использую этот образ...

Cindy Almighty / 11 марта 2019
0 голосов
1 ответ

Я перевожу фаста-нуклеотидный файл в белковые последовательности этим кодом use Bio::SeqIO; use...

BioDeveloper / 12 ноября 2018
0 голосов
0 ответов

#!/usr/bin/perl -w use strict; use Bio::AlignIO; # Creating a new AlignIO object my $in =...

Michelangelo / 24 октября 2018
0 голосов
1 ответ

У меня возникли некоторые проблемы при установке Bio-DB-HTS (https://github.com/Ensembl/Bio-DB-HTS)...

S.Jamal / 23 сентября 2018
1 голос
3 ответов

есть ли в perl (не bioperl) метод для определения числа каждых 2 последовательных букв т.е.: число...

AWRAM / 18 ноября 2011
0 голосов
1 ответ

Я запускаю локальную программу blast на сервере apche2 ... но она показывает мне, что ошибка

Manju / 04 ноября 2011
3 голосов
2 ответов

Пожалуйста, предложите, я хочу начать с 0. У меня есть опыт работы с R.

John Clark / 16 сентября 2011
1 голос
2 ответов

У меня есть два набора данных: «Данные 1» и «Данные 2».Не могли бы вы помочь мне найти для каждого...

Phan / 24 августа 2011
1 голос
1 ответ

У меня есть данные SNP и данные списка генераторов.Я ищу положение SNP cotain в данных списка генов...

Phan / 19 августа 2011
2 голосов
2 ответов

Мне нужно проанализировать предварительный файл GenBank Flatfile.Последовательность еще не была...

user81997 / 14 июня 2011
7 голосов
2 ответов

Я ищу эффективное решение для поиска максимально длинной подстроки в строке, допускающей n...

Abhi / 07 июня 2011
1 голос
2 ответов

У меня есть файл bam, и я использую bioperl (Bio :: DB :: Sam) для работы с ним. Теперь я хотел...

I3ilbo / 02 июня 2011
1 голос
1 ответ

Я попытался запустить Bio Perl, используя Eclipse. Код, который я пытался выполнить: use Bio::Seq;...

need_the_buzz / 25 февраля 2011
1 голос
1 ответ

Новичок здесь, я пытаюсь использовать модуль Bioperl в среде Perl. Моя конфигурация Windows Vista /...

thchand / 15 января 2011
3 голосов
1 ответ

Поиск неисправностей и редактирование справки. Это домашнее задание. Мой профессор поощряет...

Koala / 09 ноября 2010
0 голосов
1 ответ

Насколько я знаю, требуется запуск CPAN с sudo на Mac sudo perl -MCPAN -e shell для установки новых...

Martin Preusse / 28 октября 2010
2 голосов
1 ответ

Я использую Ubuntu 10.04 и Perl 5.10.1. В пакете BioPerl есть несколько хороших скриптов, таких как...

David B / 18 сентября 2010
1 голос
1 ответ

Я следовал Руководство BioPerl : я клонировал свежую копию bioperl-live в ~/src, а затем добавил...

David B / 18 сентября 2010
1 голос
1 ответ

Я использую perlbrew, и я хотел бы установить последнюю версию bioperl. Должен ли я использовать...

David B / 17 сентября 2010
3 голосов
3 ответов

Я хотел бы написать функцию Perl, которая получает имя файла GFF3 и диапазон (т.е. 100000 .....

David B / 08 сентября 2010
3 голосов
1 ответ

В Perl у нас есть IO::ScalarArray для обработки элементов массива подобно строкам файла. В BioPerl...

Ryan Thompson / 22 апреля 2010
1 голос
2 ответов

Как я могу изменить алгоритм Смита-Уотермана , используя матрицу замещения для выравнивания белков...

may / 09 ноября 2009
Для получения более полной информации посмотрите в списке вопросов или в популярных тегах.
Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...