Вопросы с тегом Bioconductor - PullRequest

Вопросы с тегом Bioconductor

0 голосов
1 ответ

В моей среде Windows 10 с последней версией R и RStudio я не могу загрузить многие из пакетов R,...

Naseer Ahmed / 12 октября 2019
1 голос
1 ответ

Я работаю с Rstudio и для создания сетевых визуализаций я использую Cytoscape. Я не могу найти...

Sup / 08 октября 2019
0 голосов
0 ответов

У меня большой фрейм данных. В столбце «0» записаны мои имена переменных (т.е. имена генов / AGI),...

Oncidium / 01 октября 2019
0 голосов
0 ответов

Я написал функцию для выполнения: Извлечение изображения из файла .lif в многоканальный стек .tif...

Archymedes / 24 сентября 2019
1 голос
0 ответов

Я совершенно новичок в биоинформатике, но у меня есть файл данных микрочипа (txt) с предварительно...

R. Simian / 22 сентября 2019
0 голосов
0 ответов

Я пытаюсь прочитать файлы fastq, используя следующую функцию: library("ShortRead")...

Effective Learning / 09 июля 2019
0 голосов
2 ответов

Я хотел бы JSON сериализовать expressionSet. Я попробовал следующее: # create expression set based...

Cleb / 05 июля 2019
0 голосов
0 ответов

Я бы хотел настроить внешний вид моих объектов Gviz IdeogramTrack. Я создаю эти треки, предоставляя...

Robert / 30 июня 2019
0 голосов
0 ответов

В настоящее время я работаю над взаимодействием растительных патогенов и пытаюсь создать сеть...

AISWARYA JAYAPRAKASH / 27 июня 2019
0 голосов
1 ответ

Я использую пакет R Gviz для построения моих данных глубокого секвенирования.Я работаю с...

Robert / 27 июня 2019
0 голосов
1 ответ

У меня есть два набора ExpressionSet, которые я хотел бы объединить в один с именем exprs.br.ov,...

Camellia Hilker / 18 июня 2019
0 голосов
1 ответ

Я использую пакет мышц в R для выравнивания нескольких последовательностей и хочу узнать, какое...

Zaynab / 17 июня 2019
0 голосов
0 ответов

Я пытаюсь использовать пакет normR (библиотека R) от bioconda как часть рабочего процесса создания...

Colin / 10 июня 2019
0 голосов
1 ответ

Я пытаюсь построить график подсчета на основе данных RNA-seq для отдельных генов. Меня интересуют...

AndreaWall / 10 июня 2019
0 голосов
0 ответов

Я пытаюсь выполнить GO-анализ с помощью GOFunction.Тем не менее, я новичок в R, поэтому я...

Savlat Rahmatulloev / 06 июня 2019
0 голосов
0 ответов

Когда установка Bioconductor в R-3.6 присутствует в моем альпийском образе, она выдает ошибку

Harshit Khetan / 04 июня 2019
0 голосов
0 ответов

Я пытаюсь использовать пакет GenArise для анализа микросхемы с 5 столбцами: Id, красный, зеленый,...

Fra / 02 июня 2019
2 голосов
1 ответ

При попытке установить bioconductor (для установки пакета phyloseq) я получаю несколько...

Barbs / 24 мая 2019
3 голосов
1 ответ

Мне нужно установить разные пакеты на R. ОС - это Ubuntu для Windows.Когда я пытаюсь "BiocManager...

Mark Wekking / 21 мая 2019
0 голосов
0 ответов

Я хочу обновить версию 3.9 биокондуктора на R 3.6.0, но я получаю сообщение об ошибке "путь...

Helga / 17 мая 2019
0 голосов
0 ответов

Я пытаюсь проанализировать некоторые файлы NGS, используя пакет Bioconductor-package ShortRead....

grafZahl / 09 мая 2019
0 голосов
1 ответ

Я плохо умею использовать семейство функций apply. Я хочу использовать семейство apply вместо...

J. Smith / 28 апреля 2019
0 голосов
1 ответ

Я использую ComplexHeatmap для отображения данных, однако, когда я начинаю делить матрицу, чтобы ее...

Solebay Sharp / 22 апреля 2019
2 голосов
0 ответов

Я использовал conda для установки R и WGCNA из канала bioconda, похоже, успешно: $ conda list |...

wkc / 22 апреля 2019
0 голосов
1 ответ

У меня есть блестящее приложение, работающее с flexdashboard, которое я хотел бы продолжить процесс...

Archymedes / 22 апреля 2019
Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...