Ниже приведена небольшая часть моего кода: library(biomaRt) ensembl_hsapiens <-...
Я импортировал дорожку выравнивания UCSC в R с помощью import.bw () (из пакета rtracklayer), но у...
Я новичок в пакете IRanges и не могу получить конечное значение IRange. Я могу получить значения...
Я новичок в R и хочу проанализировать экспрессию miRNA из набора данных из 3 групп.Может кто-нибудь...
У меня есть объект ExpressionSet с 100 выборками: > length(sampleNames(eset1)) 100 У меня также...
Существует ли более быстрый способ преобразования объекта RleViews (который содержит элементы...
Я новичок в Bioconductor и пытаюсь найти подходящий пакет, чтобы иметь возможность делать то, что я...
У меня во время установки генного плоттера (пакет Bioconductor). Я использую R 2.14 на Linux Mint 9
Я установил BSgenome, кажется, работает, но я не могу загрузить библиотеку.Следующий код из пакета...
Я совсем недавно начал изучать R в результате необходимости, и пока, думаю, все хорошо. Но я все...
Я должен начать с того, что я только начинаю программировать, используя R. Я не могу создать набор...
Я пытаюсь понять, как сделать классическое выражение гена пример в Bioconductor, используя Rpy2, и...
У меня есть объект affyBatch с данными экспрессии генов. Данные читаются с использованием DAT
Я пытаюсь исключить все мои пробы из ESet, в которых для одного из 10 фенотипов нет записей: У меня...
Можно ли задать поднабор ExpressionSet следующим образом: SUB = ESet [, ESet @ phenoData @ data $ x...
У меня есть ExpressionSet объект, который я хочу поместить в подмножество.Например, > str(ESet)...
Я использую Limma для анализа дифференциальных выражений генов. Для моделирования нужен дизайн и...
Я использую пакет Bioconductor CMA для выполнения внутренней перекрестной проверки Монте-Карло...
Во-первых, это может быть неправильный форум по этому вопросу, так как он чертовски специфичен для...
У меня есть data.frame в R. Он содержит много данных: уровни экспрессии генов из многих (125)...
Мне нужно создать объект типа ShortReadQ из библиотеки ShortRead в Bioconductor. ShortReadQ...
Привет всем, Я пытался загрузить определенное количество файлов Affymetrix CEL, используя...
Я пытаюсь сгенерировать объекты GOFrame, чтобы сгенерировать отображение генной онтологии в R для...
Я работаю над сценарием, который создает пакет в текущем каталоге (используя pdInfoBuilder из...