Вопросы с тегом bioconductor - PullRequest

Вопросы с тегом bioconductor

0 голосов
1 ответ

Ниже приведена небольшая часть моего кода: library(biomaRt) ensembl_hsapiens <-...

Jack Dean / 24 апреля 2018
1 голос
1 ответ

Я импортировал дорожку выравнивания UCSC в R с помощью import.bw () (из пакета rtracklayer), но у...

CPW / 28 марта 2012
0 голосов
2 ответов

Я новичок в пакете IRanges и не могу получить конечное значение IRange. Я могу получить значения...

rattlerray / 17 марта 2012
2 голосов
1 ответ

Я новичок в R и хочу проанализировать экспрессию miRNA из набора данных из 3 групп.Может кто-нибудь...

Shafi / 26 февраля 2012
7 голосов
2 ответов

У меня есть объект ExpressionSet с 100 выборками: > length(sampleNames(eset1)) 100 У меня также...

user1202664 / 10 февраля 2012
1 голос
1 ответ

Существует ли более быстрый способ преобразования объекта RleViews (который содержит элементы...

user680111 / 22 ноября 2011
2 голосов
1 ответ

Я новичок в Bioconductor и пытаюсь найти подходящий пакет, чтобы иметь возможность делать то, что я...

JoshDG / 04 ноября 2011
3 голосов
1 ответ

У меня во время установки генного плоттера (пакет Bioconductor). Я использую R 2.14 на Linux Mint 9

Nicolas Rosewick / 02 ноября 2011
1 голос
1 ответ

Я установил BSgenome, кажется, работает, но я не могу загрузить библиотеку.Следующий код из пакета...

jon / 18 сентября 2011
1 голос
1 ответ

Я совсем недавно начал изучать R в результате необходимости, и пока, думаю, все хорошо. Но я все...

Avoks / 12 сентября 2011
3 голосов
1 ответ

Я должен начать с того, что я только начинаю программировать, используя R. Я не могу создать набор...

Avin / 09 сентября 2011
2 голосов
1 ответ

Я пытаюсь понять, как сделать классическое выражение гена пример в Bioconductor, используя Rpy2, и...

telliott99 / 18 августа 2011
1 голос
1 ответ

У меня есть объект affyBatch с данными экспрессии генов. Данные читаются с использованием DAT

dynamo / 20 июня 2011
1 голос
1 ответ

Я пытаюсь исключить все мои пробы из ESet, в которых для одного из 10 фенотипов нет записей: У меня...

Azil / 02 мая 2011
3 голосов
1 ответ

Можно ли задать поднабор ExpressionSet следующим образом: SUB = ESet [, ESet @ phenoData @ data $ x...

Azil / 21 апреля 2011
2 голосов
1 ответ

У меня есть ExpressionSet объект, который я хочу поместить в подмножество.Например, > str(ESet)...

stefan / 08 апреля 2011
2 голосов
1 ответ

Я использую Limma для анализа дифференциальных выражений генов. Для моделирования нужен дизайн и...

stefan / 08 апреля 2011
5 голосов
1 ответ

Я использую пакет Bioconductor CMA для выполнения внутренней перекрестной проверки Монте-Карло...

user594694 / 09 февраля 2011
8 голосов
2 ответов

Во-первых, это может быть неправильный форум по этому вопросу, так как он чертовски специфичен для...

Mike Dewar / 05 мая 2010
7 голосов
2 ответов

У меня есть data.frame в R. Он содержит много данных: уровни экспрессии генов из многих (125)...

Mike Dewar / 19 апреля 2010
1 голос
3 ответов

Мне нужно создать объект типа ShortReadQ из библиотеки ShortRead в Bioconductor. ShortReadQ...

Jeremy Leipzig / 02 марта 2010
3 голосов
3 ответов

Привет всем, Я пытался загрузить определенное количество файлов Affymetrix CEL, используя...

Federico Giorgi / 30 ноября 2009
1 голос
2 ответов

Я пытаюсь сгенерировать объекты GOFrame, чтобы сгенерировать отображение генной онтологии в R для...

Tonio / 12 ноября 2009
3 голосов
2 ответов

Я работаю над сценарием, который создает пакет в текущем каталоге (используя pdInfoBuilder из...

Vince / 06 октября 2009
Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...